MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	TAAA	2	8	130	137	75 %	25 %	0 %	0 %	148244140
2	NC_009477	GAA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
3	NC_009477	GCA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
4	NC_009477	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	148244140
5	NC_009477	AGA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
6	NC_009477	GCA	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
7	NC_009477	TGT	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
8	NC_009477	AGA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
9	NC_009477	AGC	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
10	NC_009477	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
11	NC_009477	AACA	2	8	408	415	75 %	0 %	0 %	25 %	148244140
12	NC_009477	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244140
13	NC_009477	TGG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244140
14	NC_009477	TTG	2	6	628	633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
15	NC_009477	AGA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244140
16	NC_009477	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244140
17	NC_009477	TGA	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244140
18	NC_009477	AGC	2	6	695	700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244140
19	NC_009477	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244140
20	NC_009477	AATT	2	8	759	766	50 %	50 %	0 %	0 %	148244141
21	NC_009477	GAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244141
22	NC_009477	TCAA	2	8	909	916	50 %	25 %	0 %	25 %	148244141
23	NC_009477	AGCA	2	8	924	931	50 %	0 %	25 %	25 %	148244141
24	NC_009477	CAA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
25	NC_009477	GAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244141
26	NC_009477	TTAT	2	8	977	984	25 %	75 %	0 %	0 %	148244141
27	NC_009477	TTA	2	6	1022	1027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244141
28	NC_009477	AAC	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
29	NC_009477	AGT	2	6	1111	1116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244141
30	NC_009477	CAG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244141
31	NC_009477	GTTT	2	8	1173	1180	0 %	75 %	25 %	0 %	148244141
32	NC_009477	ATC	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244141
33	NC_009477	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244141
34	NC_009477	AAT	2	6	1262	1267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244141
35	NC_009477	ATAA	2	8	1288	1295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009477	TA	3	6	1314	1319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009477	AT	3	6	1348	1353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009477	AGA	2	6	1354	1359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009477	AAG	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009477	TAT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244142
41	NC_009477	GGA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244142
42	NC_009477	A	7	7	1501	1507	100 %	0 %	0 %	0 %	148244142
43	NC_009477	TCAA	2	8	1519	1526	50 %	25 %	0 %	25 %	148244142
44	NC_009477	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244142
45	NC_009477	AGA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244142
46	NC_009477	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244142
47	NC_009477	GGT	2	6	1649	1654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244142
48	NC_009477	ATA	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244142
49	NC_009477	ACT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009477	CT	3	6	1742	1747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009477	T	7	7	1938	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
52	NC_009477	T	6	6	1982	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
53	NC_009477	GAT	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
54	NC_009477	ATT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244143
55	NC_009477	TAA	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244143
56	NC_009477	TAA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244143
57	NC_009477	TGAT	2	8	2209	2216	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
58	NC_009477	T	6	6	2224	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
59	NC_009477	ATGT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
60	NC_009477	CG	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	148244143
61	NC_009477	AT	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
62	NC_009477	TCA	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244143
63	NC_009477	T	6	6	2341	2346	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
64	NC_009477	T	6	6	2350	2355	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
65	NC_009477	ATG	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
66	NC_009477	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
67	NC_009477	TAG	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
68	NC_009477	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244143
69	NC_009477	TAC	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009477	ATC	2	6	2624	2629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009477	GAT	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009477	ATA	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009477	GTC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009477	TC	3	6	2666	2671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009477	AG	3	6	2690	2695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009477	TCA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009477	TAT	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009477	AAT	2	6	2793	2798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009477	A	6	6	2823	2828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009477	TCAT	2	8	2926	2933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009477	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009477	TCTA	2	8	2953	2960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009477	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009477	CTA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
85	NC_009477	AT	3	6	3163	3168	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
86	NC_009477	GTG	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244144
87	NC_009477	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
88	NC_009477	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244144
89	NC_009477	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
90	NC_009477	A	6	6	3273	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
91	NC_009477	TAT	2	6	3282	3287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244144
92	NC_009477	TGA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244144
93	NC_009477	AT	3	6	3308	3313	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
94	NC_009477	GTG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244144
95	NC_009477	CG	3	6	3345	3350	0 %	0 %	50 %	50 %	148244144
96	NC_009477	ACAT	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	148244144
97	NC_009477	TTAAAC	2	12	3520	3531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244144
98	NC_009477	AAGA	2	8	3599	3606	75 %	0 %	25 %	0 %	148244144
99	NC_009477	TA	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
100	NC_009477	CAT	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244144
101	NC_009477	T	6	6	3786	3791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009477	AAC	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009477	AAT	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009477	AGG	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009477	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	148244145
106	NC_009477	TAA	3	9	3998	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
107	NC_009477	TAA	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
108	NC_009477	ACA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244145
109	NC_009477	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244145
110	NC_009477	ACA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244145
111	NC_009477	CATT	2	8	4236	4243	25 %	50 %	0 %	25 %	148244145
112	NC_009477	A	6	6	4245	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
113	NC_009477	TA	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
114	NC_009477	ATTAT	2	10	4343	4352	40 %	60 %	0 %	0 %	148244145
115	NC_009477	TAC	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244145
116	NC_009477	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
117	NC_009477	TA	3	6	4411	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
118	NC_009477	TAA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244145
119	NC_009477	AAAAG	2	10	4442	4451	80 %	0 %	20 %	0 %	148244145
120	NC_009477	TTATT	2	10	4536	4545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009477	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
122	NC_009477	A	6	6	4578	4583	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
123	NC_009477	ATA	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
124	NC_009477	TTG	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244146
125	NC_009477	AAT	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
126	NC_009477	TAA	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
127	NC_009477	AGA	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244146
128	NC_009477	ATG	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244146
129	NC_009477	ACAAT	2	10	4816	4825	60 %	20 %	0 %	20 %	148244146
130	NC_009477	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
131	NC_009477	AAT	2	6	4871	4876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
132	NC_009477	TAA	2	6	4917	4922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
133	NC_009477	CTTT	2	8	4944	4951	0 %	75 %	0 %	25 %	148244146
134	NC_009477	T	6	6	4949	4954	0 %	100 %	0 %	0 %	148244146
135	NC_009477	TAA	2	6	5008	5013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
136	NC_009477	ACA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244146
137	NC_009477	ATTCA	2	10	5139	5148	40 %	40 %	0 %	20 %	148244146
138	NC_009477	ATAGAT	2	12	5171	5182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244146
139	NC_009477	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244146
140	NC_009477	AT	3	6	5210	5215	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
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